Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700016D06RikQ9DAA5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700016D06RikQ9DAA5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700016D06RikQ9DAA5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700016D06RikQ9DAA5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms