Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9DAA3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9DAA3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9DAA3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9DAA3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9DAA3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DAA3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DAA3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms