Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Speer4bQ9D9F7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Speer4bQ9D9F7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Speer4bQ9D9F7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4bQ9D9F7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms