Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700109H08RikQ9D9C0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700109H08RikQ9D9C0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700109H08RikQ9D9C0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms