Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rexo2Q9D8S4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms