Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c6Q9D8P7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c6Q9D8P7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms