Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Capn9Q9D805 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn9Q9D805 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms