Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Chmp4cQ9D7F7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chmp4cQ9D7F7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chmp4cQ9D7F7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4cQ9D7F7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms