Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbe1Q9D6Y9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbe1Q9D6Y9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms