Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc39Q9D5Y1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc39Q9D5Y1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms