Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubxn11Q9D572 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn11Q9D572 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn11Q9D572 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn11Q9D572 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn11Q9D572 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms