Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc130Q9D516 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc130Q9D516 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms