Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrameQ9D4Z5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrameQ9D4Z5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrameQ9D4Z5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms