Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931428L18RikQ9D4S9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4931428L18RikQ9D4S9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms