Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gpn3Q9D3W4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpn3Q9D3W4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms