Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4cQ9D3F6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ms4a4cQ9D3F6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4cQ9D3F6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms