Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ToporslQ9D2F8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ToporslQ9D2F8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ToporslQ9D2F8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ToporslQ9D2F8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms