Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc6bQ9D289 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc6bQ9D289 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc6bQ9D289 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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