Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Syf2Q9D198 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syf2Q9D198 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Syf2Q9D198 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syf2Q9D198 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms