Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D131 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D131 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D131 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D131 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D131 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D131 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D131 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D131 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D131 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D131 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D131 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D131 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D131 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D131 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D131 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D131 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D131 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D131 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9D131 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9D131 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D131 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D131 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D131 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D131 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D131 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D131 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D131 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D131 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D131 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D131 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D131 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D131 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D131 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D131 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D131 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D131 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D131 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D131 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D131 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D131 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D131 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D131 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D131 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D131 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D131 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D131 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D131 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D131 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D131 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D131 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D131 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D131 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D131 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D131 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9D131 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9D131 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D131 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D131 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D131 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D131 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D131 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D131 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D131 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9D131 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D131 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D131 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9D131 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms