Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Arv1Q9D0U9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arv1Q9D0U9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Arv1Q9D0U9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms