Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gtf2e1Q9D0D5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gtf2e1Q9D0D5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms