Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ribc1Q9D0B8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ribc1Q9D0B8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ribc1Q9D0B8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ribc1Q9D0B8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms