Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc47Q9D024 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc47Q9D024 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc47Q9D024 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
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