Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisa9Q9CZN4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisa9Q9CZN4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisa9Q9CZN4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms