Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snf8Q9CZ28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snf8Q9CZ28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Snf8Q9CZ28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snf8Q9CZ28 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1473.4 ms