Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prelid3bQ9CYY7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prelid3bQ9CYY7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms