Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssu72Q9CY97 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssu72Q9CY97 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ssu72Q9CY97 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms