Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp8Q9CY28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gtpbp8Q9CY28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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