Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Mis12Q9CY25 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mis12Q9CY25 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms