Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Bud23Q9CY21 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bud23Q9CY21 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bud23Q9CY21 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bud23Q9CY21 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms