Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RpainQ9CWY9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RpainQ9CWY9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms