Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smyd3Q9CWR2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smyd3Q9CWR2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smyd3Q9CWR2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smyd3Q9CWR2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms