Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smc1aQ9CU62 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smc1aQ9CU62 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smc1aQ9CU62 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms