Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chchd3Q9CRB9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Chchd3Q9CRB9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chchd3Q9CRB9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chchd3Q9CRB9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd3Q9CRB9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chchd3Q9CRB9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms