Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5sQ9CRA7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp5sQ9CRA7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp5sQ9CRA7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms