Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ska2Q9CR46 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ska2Q9CR46 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms