Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldnd1Q9CQX5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldnd1Q9CQX5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldnd1Q9CQX5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldnd1Q9CQX5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms