Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PompQ9CQT5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PompQ9CQT5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PompQ9CQT5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms