Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed6Q9CQG0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms