Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sar1bQ9CQC9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sar1bQ9CQC9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sar1bQ9CQC9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms