Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nudcd2Q9CQ48 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nudcd2Q9CQ48 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms