Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NsmfQ99NF2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NsmfQ99NF2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NsmfQ99NF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NsmfQ99NF2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms