Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acss1Q99NB1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acss1Q99NB1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acss1Q99NB1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms