Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atoh8Q99NA2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atoh8Q99NA2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atoh8Q99NA2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms