Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl1Q99N96 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl1Q99N96 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl1Q99N96 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms