Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kremen1Q99N43 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kremen1Q99N43 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kremen1Q99N43 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kremen1Q99N43 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kremen1Q99N43 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kremen1Q99N43 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kremen1Q99N43 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kremen1Q99N43 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kremen1Q99N43 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kremen1Q99N43 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms