Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ms4a6cQ99N08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a6cQ99N08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms