Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a6dQ99N07 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a6dQ99N07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms