Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SrrtQ99MR6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SrrtQ99MR6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SrrtQ99MR6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SrrtQ99MR6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms